Достаточно интересным и «живым» музеем в городе является музей русских суеверий. Это одно из тех мест, что посмотреть в Калининграде в сентябре, его основными объектами являются деревянные фигуры, которые изображают различных мифологических персонажей. Этот музей был сформирован в 2002 году при помощи Фонда национальных парков и М. Семенова, который является автором экспозиции. Экспозиция, которая находится в музее на сегодняшний день, играет большую роль в образовании школьников, а представление мифических домовых, водяных, леших в осязаемом образе позволяет расширить знания в области мифологии и древней истории. Музей русских суеверий находится в большом деревянном доме — там и живут лесные чудища и духи. Узнать, кем является от или иной персонаж можно с помощью таблички, которая расположена под каждой фигурой.
В городе находится первый в России музей маринистической направленности - Калининградский Музей Мирового океана. Этот музей основали 12 апреля 1990 года. Его экспозиции посвящены судоходству, морской флоре и фауне, геологии и гидрологии мирового океана. Также тут имеется обширная маринистическая библиотека и экологическая станция. Главным экспонатом тут считается легендарное научно-исследовательское судно «Витязь», внесшее выдающуюся лепту в исследование Мирового океана. Кроме этого, все посетители могут осмотреть научно-исследовательское судно «Космонавт Виктор Пацаев», подводную лодку «Б-413», павильон «Кашалот», увидеть коллекцию старинных пушек и якорей. На территории музея, одного из тех мест, что посмотреть в Калининграде в сентябре проводятся конгрессы, действуют тематические клубы, постоянно ведется научная работа.
Интересным местом для того чтобы узнать, что посмотреть в Калининграде в сентябре является Морской музей. Научный морской музей Атлантического научно-исследовательского института морского рыбного хозяйства и океанографии включает в себя огромнейшую коллекцию морской флоры и фауны. На протяжении всего времени существования музея коллекция тут пополнялась, и на сегодняшний день тут собрано более 100 тысяч уникальных экземпляров. Экспонаты экзотических рыб — как самые редкие, так и распространенные виды морских обитателей вод Атлантики, Антарктики и тропических зон Тихого океана.